Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms