Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VIL1P09327 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VIL1P09327 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VIL1P09327 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VIL1P09327 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VIL1P09327 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VIL1P09327 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VIL1P09327 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VIL1P09327 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VIL1P09327 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VIL1P09327 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VIL1P09327 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VIL1P09327 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VIL1P09327 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VIL1P09327 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VIL1P09327 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VIL1P09327 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VIL1P09327 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VIL1P09327 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VIL1P09327 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VIL1P09327 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VIL1P09327 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VIL1P09327 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VIL1P09327 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VIL1P09327 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VIL1P09327 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VIL1P09327 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VIL1P09327 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VIL1P09327 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VIL1P09327 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VIL1P09327 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VIL1P09327 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VIL1P09327 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VIL1P09327 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VIL1P09327 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VIL1P09327 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VIL1P09327 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VIL1P09327 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VIL1P09327 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VIL1P09327 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VIL1P09327 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VIL1P09327 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VIL1P09327 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VIL1P09327 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VIL1P09327 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VIL1P09327 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VIL1P09327 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VIL1P09327 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VIL1P09327 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VIL1P09327 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIL1P09327 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIL1P09327 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIL1P09327 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIL1P09327 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIL1P09327 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIL1P09327 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIL1P09327 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIL1P09327 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIL1P09327 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIL1P09327 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIL1P09327 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIL1P09327 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIL1P09327 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIL1P09327 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIL1P09327 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIL1P09327 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIL1P09327 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIL1P09327 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIL1P09327 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIL1P09327 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIL1P09327 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIL1P09327 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIL1P09327 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIL1P09327 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIL1P09327 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIL1P09327 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIL1P09327 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIL1P09327 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VIL1P09327 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIL1P09327 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIL1P09327 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIL1P09327 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIL1P09327 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIL1P09327 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIL1P09327 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIL1P09327 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIL1P09327 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIL1P09327 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIL1P09327 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIL1P09327 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIL1P09327 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIL1P09327 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIL1P09327 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIL1P09327 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VIL1P09327 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VIL1P09327 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VIL1P09327 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VIL1P09327 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
VIL1P09327 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VIL1P09327 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms