Protein–RNA interactions for Protein: P04179

SOD2, Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD2P04179 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOD2P04179 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOD2P04179 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SOD2P04179 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOD2P04179 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOD2P04179 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOD2P04179 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOD2P04179 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOD2P04179 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOD2P04179 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOD2P04179 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOD2P04179 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOD2P04179 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOD2P04179 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOD2P04179 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOD2P04179 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOD2P04179 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOD2P04179 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOD2P04179 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOD2P04179 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOD2P04179 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOD2P04179 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOD2P04179 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOD2P04179 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOD2P04179 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SOD2P04179 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOD2P04179 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOD2P04179 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOD2P04179 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOD2P04179 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOD2P04179 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOD2P04179 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOD2P04179 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOD2P04179 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOD2P04179 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOD2P04179 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOD2P04179 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOD2P04179 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOD2P04179 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOD2P04179 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOD2P04179 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOD2P04179 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOD2P04179 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOD2P04179 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOD2P04179 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOD2P04179 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOD2P04179 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOD2P04179 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SOD2P04179 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOD2P04179 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOD2P04179 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOD2P04179 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOD2P04179 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOD2P04179 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOD2P04179 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOD2P04179 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOD2P04179 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOD2P04179 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SOD2P04179 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOD2P04179 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SOD2P04179 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOD2P04179 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SOD2P04179 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SOD2P04179 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOD2P04179 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOD2P04179 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOD2P04179 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOD2P04179 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOD2P04179 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOD2P04179 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOD2P04179 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOD2P04179 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOD2P04179 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOD2P04179 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOD2P04179 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOD2P04179 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOD2P04179 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SOD2P04179 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOD2P04179 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOD2P04179 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOD2P04179 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOD2P04179 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOD2P04179 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOD2P04179 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SOD2P04179 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOD2P04179 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOD2P04179 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SOD2P04179 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOD2P04179 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOD2P04179 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SOD2P04179 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOD2P04179 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOD2P04179 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOD2P04179 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOD2P04179 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOD2P04179 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOD2P04179 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOD2P04179 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOD2P04179 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOD2P04179 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms