Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC3P02656 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC3P02656 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC3P02656 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC3P02656 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC3P02656 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC3P02656 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC3P02656 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC3P02656 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC3P02656 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC3P02656 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC3P02656 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC3P02656 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC3P02656 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC3P02656 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC3P02656 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC3P02656 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC3P02656 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC3P02656 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC3P02656 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC3P02656 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC3P02656 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC3P02656 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC3P02656 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC3P02656 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC3P02656 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC3P02656 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC3P02656 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC3P02656 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC3P02656 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC3P02656 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC3P02656 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC3P02656 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC3P02656 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC3P02656 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC3P02656 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC3P02656 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC3P02656 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC3P02656 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC3P02656 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC3P02656 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC3P02656 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC3P02656 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC3P02656 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC3P02656 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC3P02656 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC3P02656 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC3P02656 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC3P02656 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC3P02656 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC3P02656 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC3P02656 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC3P02656 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC3P02656 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC3P02656 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC3P02656 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC3P02656 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC3P02656 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC3P02656 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC3P02656 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC3P02656 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC3P02656 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC3P02656 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC3P02656 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC3P02656 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC3P02656 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC3P02656 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC3P02656 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC3P02656 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC3P02656 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC3P02656 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC3P02656 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms