Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNB1P01574 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms