Protein–RNA interactions for Protein: O95714

HERC2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, humanhuman

Predictions only

Length 4,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2O95714 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC2O95714 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC2O95714 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC2O95714 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC2O95714 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC2O95714 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC2O95714 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC2O95714 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC2O95714 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC2O95714 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC2O95714 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC2O95714 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC2O95714 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC2O95714 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC2O95714 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC2O95714 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC2O95714 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC2O95714 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC2O95714 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC2O95714 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC2O95714 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC2O95714 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC2O95714 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC2O95714 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC2O95714 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC2O95714 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC2O95714 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC2O95714 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC2O95714 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC2O95714 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC2O95714 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC2O95714 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC2O95714 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC2O95714 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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HERC2O95714 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC2O95714 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC2O95714 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC2O95714 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC2O95714 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC2O95714 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC2O95714 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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HERC2O95714 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HERC2O95714 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HERC2O95714 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERC2O95714 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HERC2O95714 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERC2O95714 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERC2O95714 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HERC2O95714 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC2O95714 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC2O95714 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC2O95714 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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HERC2O95714 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC2O95714 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC2O95714 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC2O95714 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC2O95714 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC2O95714 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC2O95714 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC2O95714 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HERC2O95714 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC2O95714 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC2O95714 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC2O95714 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC2O95714 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC2O95714 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HERC2O95714 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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