Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX3O95076 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX3O95076 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX3O95076 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX3O95076 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX3O95076 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX3O95076 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX3O95076 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX3O95076 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX3O95076 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX3O95076 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX3O95076 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX3O95076 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX3O95076 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX3O95076 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX3O95076 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX3O95076 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX3O95076 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX3O95076 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX3O95076 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX3O95076 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX3O95076 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX3O95076 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX3O95076 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX3O95076 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX3O95076 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX3O95076 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX3O95076 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX3O95076 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX3O95076 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX3O95076 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX3O95076 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX3O95076 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX3O95076 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX3O95076 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX3O95076 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX3O95076 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX3O95076 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX3O95076 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX3O95076 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX3O95076 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX3O95076 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX3O95076 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ALX3O95076 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ALX3O95076 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ALX3O95076 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ALX3O95076 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ALX3O95076 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ALX3O95076 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX3O95076 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX3O95076 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX3O95076 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX3O95076 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX3O95076 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX3O95076 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX3O95076 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX3O95076 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX3O95076 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX3O95076 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX3O95076 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX3O95076 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX3O95076 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX3O95076 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX3O95076 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX3O95076 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX3O95076 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX3O95076 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX3O95076 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX3O95076 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX3O95076 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX3O95076 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX3O95076 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX3O95076 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX3O95076 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX3O95076 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX3O95076 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX3O95076 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX3O95076 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX3O95076 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX3O95076 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX3O95076 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX3O95076 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX3O95076 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX3O95076 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX3O95076 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX3O95076 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX3O95076 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX3O95076 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX3O95076 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX3O95076 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX3O95076 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX3O95076 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX3O95076 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX3O95076 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX3O95076 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX3O95076 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX3O95076 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX3O95076 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX3O95076 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALX3O95076 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms