Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC45O75419 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC45O75419 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC45O75419 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC45O75419 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC45O75419 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC45O75419 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC45O75419 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC45O75419 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC45O75419 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC45O75419 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC45O75419 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC45O75419 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC45O75419 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC45O75419 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC45O75419 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC45O75419 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC45O75419 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC45O75419 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC45O75419 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC45O75419 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC45O75419 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC45O75419 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC45O75419 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC45O75419 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC45O75419 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC45O75419 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC45O75419 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC45O75419 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC45O75419 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC45O75419 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC45O75419 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC45O75419 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC45O75419 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC45O75419 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC45O75419 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC45O75419 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC45O75419 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC45O75419 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC45O75419 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC45O75419 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC45O75419 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC45O75419 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC45O75419 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC45O75419 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC45O75419 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC45O75419 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC45O75419 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC45O75419 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC45O75419 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC45O75419 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC45O75419 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC45O75419 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC45O75419 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC45O75419 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC45O75419 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC45O75419 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC45O75419 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC45O75419 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC45O75419 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC45O75419 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC45O75419 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC45O75419 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC45O75419 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC45O75419 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC45O75419 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC45O75419 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC45O75419 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC45O75419 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC45O75419 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC45O75419 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC45O75419 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC45O75419 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC45O75419 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC45O75419 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC45O75419 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC45O75419 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC45O75419 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC45O75419 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC45O75419 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC45O75419 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC45O75419 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC45O75419 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC45O75419 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC45O75419 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC45O75419 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC45O75419 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC45O75419 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC45O75419 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC45O75419 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC45O75419 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC45O75419 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC45O75419 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC45O75419 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC45O75419 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC45O75419 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC45O75419 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC45O75419 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC45O75419 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC45O75419 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms