Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPSNAP2O75323 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP2O75323 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms