Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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TIMM17BO60830 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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TIMM17BO60830 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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TIMM17BO60830 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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