Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MARCH6O60337 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms