Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX16O60231 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX16O60231 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX16O60231 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX16O60231 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX16O60231 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX16O60231 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX16O60231 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX16O60231 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX16O60231 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX16O60231 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX16O60231 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX16O60231 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX16O60231 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX16O60231 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX16O60231 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX16O60231 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX16O60231 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX16O60231 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX16O60231 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX16O60231 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX16O60231 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX16O60231 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX16O60231 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX16O60231 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX16O60231 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX16O60231 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX16O60231 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX16O60231 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX16O60231 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX16O60231 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX16O60231 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX16O60231 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX16O60231 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX16O60231 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX16O60231 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX16O60231 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX16O60231 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX16O60231 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX16O60231 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX16O60231 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX16O60231 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX16O60231 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX16O60231 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX16O60231 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX16O60231 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX16O60231 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX16O60231 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX16O60231 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX16O60231 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX16O60231 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX16O60231 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX16O60231 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX16O60231 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX16O60231 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX16O60231 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX16O60231 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX16O60231 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX16O60231 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX16O60231 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX16O60231 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX16O60231 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX16O60231 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX16O60231 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX16O60231 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX16O60231 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX16O60231 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX16O60231 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX16O60231 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX16O60231 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX16O60231 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX16O60231 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX16O60231 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX16O60231 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX16O60231 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX16O60231 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX16O60231 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX16O60231 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX16O60231 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX16O60231 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX16O60231 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX16O60231 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX16O60231 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX16O60231 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX16O60231 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX16O60231 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX16O60231 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX16O60231 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX16O60231 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX16O60231 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX16O60231 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX16O60231 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX16O60231 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX16O60231 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX16O60231 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX16O60231 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX16O60231 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX16O60231 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX16O60231 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX16O60231 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms