Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKAB2O43741 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKAB2O43741 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms