Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSTPIP1O43586 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSTPIP1O43586 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms