Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATP8B1O43520 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8B1O43520 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms