Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SART1O43290 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SART1O43290 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SART1O43290 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SART1O43290 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SART1O43290 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SART1O43290 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SART1O43290 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SART1O43290 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SART1O43290 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SART1O43290 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SART1O43290 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SART1O43290 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SART1O43290 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SART1O43290 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SART1O43290 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SART1O43290 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SART1O43290 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SART1O43290 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SART1O43290 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SART1O43290 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SART1O43290 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SART1O43290 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SART1O43290 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SART1O43290 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SART1O43290 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SART1O43290 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SART1O43290 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SART1O43290 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SART1O43290 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SART1O43290 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SART1O43290 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SART1O43290 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SART1O43290 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SART1O43290 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SART1O43290 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SART1O43290 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SART1O43290 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SART1O43290 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SART1O43290 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SART1O43290 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SART1O43290 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SART1O43290 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SART1O43290 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SART1O43290 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SART1O43290 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SART1O43290 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SART1O43290 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SART1O43290 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SART1O43290 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SART1O43290 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SART1O43290 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SART1O43290 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SART1O43290 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SART1O43290 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SART1O43290 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SART1O43290 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SART1O43290 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SART1O43290 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SART1O43290 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SART1O43290 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SART1O43290 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SART1O43290 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SART1O43290 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SART1O43290 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SART1O43290 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SART1O43290 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SART1O43290 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SART1O43290 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SART1O43290 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SART1O43290 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SART1O43290 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SART1O43290 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SART1O43290 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SART1O43290 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SART1O43290 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SART1O43290 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SART1O43290 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SART1O43290 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SART1O43290 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SART1O43290 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SART1O43290 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SART1O43290 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SART1O43290 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SART1O43290 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SART1O43290 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SART1O43290 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SART1O43290 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SART1O43290 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SART1O43290 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SART1O43290 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SART1O43290 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SART1O43290 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SART1O43290 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SART1O43290 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SART1O43290 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SART1O43290 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SART1O43290 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SART1O43290 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SART1O43290 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms