Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DYNC1LI2O43237 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms