Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE40O14503 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHE40O14503 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms