Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PMD0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PMD0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PMD0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PMD0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PMD0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PMD0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PMD0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PMD0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PMD0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PMD0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PMD0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PMD0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PMD0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PMD0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PMD0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PMD0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PMD0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PMD0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PMD0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PMD0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PMD0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PMD0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PMD0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PMD0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PMD0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PMD0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PMD0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PMD0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PMD0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PMD0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E9PMD0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PMD0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PMD0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PMD0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PMD0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PMD0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PMD0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PMD0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PMD0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PMD0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PMD0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PMD0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PMD0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PMD0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PMD0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PMD0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PMD0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PMD0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PMD0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PMD0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E9PMD0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PMD0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PMD0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PMD0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PMD0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PMD0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PMD0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PMD0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PMD0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PMD0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PMD0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PMD0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PMD0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PMD0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PMD0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PMD0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PMD0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PMD0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PMD0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PMD0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PMD0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PMD0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PMD0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PMD0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PMD0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PMD0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PMD0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PMD0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PMD0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PMD0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PMD0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PMD0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PMD0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PMD0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PMD0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PMD0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PMD0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PMD0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PMD0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PMD0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PMD0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PMD0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PMD0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PMD0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PMD0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PMD0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PMD0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PMD0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PMD0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms