Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP17L13C9JLJ4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L13C9JLJ4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms