Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KNCNA6PVL3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms