Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23AA6NH52 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23AA6NH52 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms