Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms