Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms