Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms