Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 NONO-210ENST00000472185 397 ntTSL 56.99□□□□□ -1.293e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.011e-15■■■□□ 14.6
UTP3Q9NQZ2 HMGB2-204ENST00000506267 629 ntTSL 324■■□□□ 1.431e-8■■■□□ 14.6
UTP3Q9NQZ2 PTBP1-206ENST00000585856 1217 ntTSL 228.03■■■□□ 2.082e-7■■■□□ 14.6
UTP3Q9NQZ2 COX7C-201ENST00000247655 666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.673e-8■■■□□ 14.6
UTP3Q9NQZ2 COX7C-207ENST00000515763 347 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.673e-8■■■□□ 14.6
UTP3Q9NQZ2 COX7C-203ENST00000509578 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.083e-8■■■□□ 14.6
UTP3Q9NQZ2 COX7C-206ENST00000513124 693 ntTSL 57.58□□□□□ -1.23e-8■■■□□ 14.6
UTP3Q9NQZ2 COX7C-202ENST00000505430 496 ntTSL 36.52□□□□□ -1.373e-8■■■□□ 14.6
UTP3Q9NQZ2 COX7C-205ENST00000511472 369 ntTSL 26.44□□□□□ -1.383e-8■■■□□ 14.6
UTP3Q9NQZ2 PSAP-204ENST00000495196 344 ntTSL 212.91□□□□□ -0.345e-7■■■□□ 14.6
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH3-211ENST00000491200 2308 ntTSL 1 (best)15.39■□□□□ 0.053e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH3-206ENST00000478698 1507 ntTSL 215.12■□□□□ 0.013e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH3-210ENST00000490442 1521 ntTSL 215.12■□□□□ 0.013e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH3-208ENST00000481819 2704 ntTSL 1 (best)14.15□□□□□ -0.143e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 BAG6-243ENST00000434444 766 ntTSL 318.89■□□□□ 0.613e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 BAG6-251ENST00000452994 880 ntTSL 317.17■□□□□ 0.343e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 BAG6-244ENST00000435080 1710 ntTSL 515.79■□□□□ 0.123e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 BAG6-254ENST00000456286 807 ntTSL 1 (best)14.18□□□□□ -0.143e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 BAG6-253ENST00000454165 544 ntTSL 313.56□□□□□ -0.243e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 BAG6-255ENST00000456622 859 ntTSL 512.9□□□□□ -0.343e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 BAG6-239ENST00000424176 747 ntTSL 312.62□□□□□ -0.393e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 BAG6-241ENST00000428326 1051 ntTSL 512.48□□□□□ -0.413e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 BAG6-242ENST00000433828 902 ntTSL 211.65□□□□□ -0.543e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 LRIG2-202ENST00000466069 564 ntTSL 27.09□□□□□ -1.273e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 KPNB1-207ENST00000579901 594 ntTSL 410.31□□□□□ -0.767e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 KPNB1-213ENST00000583013 742 ntTSL 38.58□□□□□ -1.047e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 KPNB1-206ENST00000578718 550 ntTSL 36.66□□□□□ -1.347e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 KPNB1-208ENST00000580019 427 ntTSL 25.46□□□□□ -1.547e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 FLNA-215ENST00000474358 696 ntTSL 218.61■□□□□ 0.571e-6■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.743e-9■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.733e-9■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.173e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 RPS24-209ENST00000476545 815 ntTSL 313.8□□□□□ -0.23e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 SUPT6H-210ENST00000584285 446 ntTSL 313.33□□□□□ -0.283e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 PKN1-208ENST00000586900 550 ntTSL 313.16□□□□□ -0.33e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.343e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 RPS24-212ENST00000482069 539 ntTSL 311.9□□□□□ -0.53e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 PSMD8-208ENST00000592561 771 ntTSL 211.7□□□□□ -0.543e-9■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 RPS24-206ENST00000465692 778 ntTSL 210.8□□□□□ -0.683e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 VRK1-203ENST00000555067 604 ntTSL 310.62□□□□□ -0.713e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 VRK1-206ENST00000557222 1029 ntTSL 59.15□□□□□ -0.943e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 VRK1-207ENST00000557352 599 ntTSL 58.97□□□□□ -0.973e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 RPS24-202ENST00000372360 510 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.013e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 RPS24-210ENST00000478655 727 ntTSL 1 (best)7.89□□□□□ -1.153e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.193e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 RPS24-213ENST00000485708 544 ntTSL 26.83□□□□□ -1.323e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 FXR1-204ENST00000461044 601 ntTSL 45.26□□□□□ -1.573e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 FUBP1-205ENST00000470287 726 ntTSL 33.21□□□□□ -1.93e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 DDX39B-217ENST00000474961 974 ntTSL 210.24□□□□□ -0.771e-6■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 VEGFA-214ENST00000493786 551 ntTSL 28.15□□□□□ -1.14e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.444e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.344e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.694e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-218ENST00000454523 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.85■□□□□ 0.454e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-207ENST00000361140 2701 ntTSL 1 (best)17.76■□□□□ 0.434e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.364e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.334e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-217ENST00000443231 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.04■□□□□ 0.324e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-221ENST00000476093 1037 ntTSL 315.89■□□□□ 0.134e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-220ENST00000476027 927 ntTSL 314.77□□□□□ -0.054e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.084e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.134e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-209ENST00000368330 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.444e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-204ENST00000354691 2498 ntTSL 211.8□□□□□ -0.524e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-215ENST00000436865 2684 ntTSL 1 (best)9.28□□□□□ -0.924e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-203ENST00000347088 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.954e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 BAG6-250ENST00000451898 993 ntTSL 319.98■□□□□ 0.792e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 BAG6-248ENST00000441054 654 ntTSL 318.89■□□□□ 0.612e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 BAG6-240ENST00000424480 1056 ntTSL 217.65■□□□□ 0.422e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 AC092073.1-201ENST00000592740 625 ntAPPRIS P1 TSL 318.51■□□□□ 0.553e-8■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 GPI-203ENST00000586077 3053 nt11.79□□□□□ -0.523e-8■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 MPP1-210ENST00000462825 587 ntTSL 414.26□□□□□ -0.131e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 MPP1-214ENST00000488694 550 ntTSL 28.01□□□□□ -1.131e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 DMTF1-230ENST00000580710 635 ntTSL 526.58■■□□□ 1.852e-7■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 DMTF1-226ENST00000579592 579 ntTSL 416.83■□□□□ 0.282e-7■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 DMTF1-237ENST00000584457 569 ntTSL 416.29■□□□□ 0.22e-7■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 DMTF1-205ENST00000414630 627 ntTSL 59.02□□□□□ -0.972e-7■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 DMTF1-212ENST00000432366 557 ntTSL 58.93□□□□□ -0.982e-7■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 DMTF1-217ENST00000448598 572 ntTSL 47.26□□□□□ -1.252e-7■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 DMTF1-207ENST00000423590 545 ntTSL 56.15□□□□□ -1.422e-7■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 DMTF1-210ENST00000428819 533 ntTSL 45.76□□□□□ -1.492e-7■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.187e-6■■□□□ 14.2
UTP3Q9NQZ2 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.057e-6■■□□□ 14.2
UTP3Q9NQZ2 ORC6-204ENST00000566860 1699 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.217e-6■■□□□ 14.2
UTP3Q9NQZ2 ORC6-209ENST00000575571 771 ntTSL 311.83□□□□□ -0.527e-6■■□□□ 14.2
UTP3Q9NQZ2 ORC6-205ENST00000567000 1560 ntTSL 210.97□□□□□ -0.657e-6■■□□□ 14.2
UTP3Q9NQZ2 SRSF1-202ENST00000578430 689 ntTSL 214.37□□□□□ -0.111e-6■■□□□ 14.2
UTP3Q9NQZ2 PPIB-203ENST00000561048 1208 ntTSL 1 (best)14.3□□□□□ -0.124e-9■■□□□ 14.1
UTP3Q9NQZ2 EIF2AK1-203ENST00000431744 806 ntTSL 327.8■■■□□ 2.042e-8■■□□□ 14.1
UTP3Q9NQZ2 EIF2AK1-204ENST00000446699 573 ntTSL 427.8■■■□□ 2.042e-8■■□□□ 14.1
UTP3Q9NQZ2 EIF2AK1-205ENST00000461493 631 ntTSL 221.67■■□□□ 1.062e-8■■□□□ 14.1
UTP3Q9NQZ2 EIF2AK1-206ENST00000463213 791 ntTSL 217.37■□□□□ 0.372e-8■■□□□ 14.1
UTP3Q9NQZ2 CDC27-218ENST00000575830 397 ntTSL 56.49□□□□□ -1.372e-8■■□□□ 14.1
UTP3Q9NQZ2 XPO1-219ENST00000481073 3706 ntTSL 23.77□□□□□ -1.812e-6■■□□□ 14.1
UTP3Q9NQZ2 VEGFA-221ENST00000520265 336 ntTSL 515.2■□□□□ 0.021e-6■■□□□ 14
UTP3Q9NQZ2 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.061e-6■■□□□ 14
UTP3Q9NQZ2 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.121e-6■■□□□ 14
UTP3Q9NQZ2 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.21e-6■■□□□ 14
UTP3Q9NQZ2 VEGFA-225ENST00000523950 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.271e-6■■□□□ 14
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