Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 NONO-210ENST00000472185 397 ntTSL 56.99□□□□□ -1.293e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.011e-15■■■□□ 14.6
UTP3Q9NQZ2 HMGB2-204ENST00000506267 629 ntTSL 324■■□□□ 1.431e-8■■■□□ 14.6
UTP3Q9NQZ2 PTBP1-206ENST00000585856 1217 ntTSL 228.03■■■□□ 2.082e-7■■■□□ 14.6
UTP3Q9NQZ2 COX7C-201ENST00000247655 666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.673e-8■■■□□ 14.6
UTP3Q9NQZ2 COX7C-207ENST00000515763 347 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.673e-8■■■□□ 14.6
UTP3Q9NQZ2 COX7C-203ENST00000509578 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.083e-8■■■□□ 14.6
UTP3Q9NQZ2 COX7C-206ENST00000513124 693 ntTSL 57.58□□□□□ -1.23e-8■■■□□ 14.6
UTP3Q9NQZ2 COX7C-202ENST00000505430 496 ntTSL 36.52□□□□□ -1.373e-8■■■□□ 14.6
UTP3Q9NQZ2 COX7C-205ENST00000511472 369 ntTSL 26.44□□□□□ -1.383e-8■■■□□ 14.6
UTP3Q9NQZ2 PSAP-204ENST00000495196 344 ntTSL 212.91□□□□□ -0.345e-7■■■□□ 14.6
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH3-211ENST00000491200 2308 ntTSL 1 (best)15.39■□□□□ 0.053e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH3-206ENST00000478698 1507 ntTSL 215.12■□□□□ 0.013e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH3-210ENST00000490442 1521 ntTSL 215.12■□□□□ 0.013e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH3-208ENST00000481819 2704 ntTSL 1 (best)14.15□□□□□ -0.143e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 BAG6-243ENST00000434444 766 ntTSL 318.89■□□□□ 0.613e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 BAG6-251ENST00000452994 880 ntTSL 317.17■□□□□ 0.343e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 BAG6-244ENST00000435080 1710 ntTSL 515.79■□□□□ 0.123e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 BAG6-254ENST00000456286 807 ntTSL 1 (best)14.18□□□□□ -0.143e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 BAG6-253ENST00000454165 544 ntTSL 313.56□□□□□ -0.243e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 BAG6-255ENST00000456622 859 ntTSL 512.9□□□□□ -0.343e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 BAG6-239ENST00000424176 747 ntTSL 312.62□□□□□ -0.393e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 BAG6-241ENST00000428326 1051 ntTSL 512.48□□□□□ -0.413e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 BAG6-242ENST00000433828 902 ntTSL 211.65□□□□□ -0.543e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 LRIG2-202ENST00000466069 564 ntTSL 27.09□□□□□ -1.273e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 KPNB1-207ENST00000579901 594 ntTSL 410.31□□□□□ -0.767e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 KPNB1-213ENST00000583013 742 ntTSL 38.58□□□□□ -1.047e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 KPNB1-206ENST00000578718 550 ntTSL 36.66□□□□□ -1.347e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 KPNB1-208ENST00000580019 427 ntTSL 25.46□□□□□ -1.547e-6■■□□□ 14.5
UTP3Q9NQZ2 FLNA-215ENST00000474358 696 ntTSL 218.61■□□□□ 0.571e-6■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.743e-9■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.733e-9■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.173e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 RPS24-209ENST00000476545 815 ntTSL 313.8□□□□□ -0.23e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 SUPT6H-210ENST00000584285 446 ntTSL 313.33□□□□□ -0.283e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 PKN1-208ENST00000586900 550 ntTSL 313.16□□□□□ -0.33e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.343e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 RPS24-212ENST00000482069 539 ntTSL 311.9□□□□□ -0.53e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 PSMD8-208ENST00000592561 771 ntTSL 211.7□□□□□ -0.543e-9■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 RPS24-206ENST00000465692 778 ntTSL 210.8□□□□□ -0.683e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 VRK1-203ENST00000555067 604 ntTSL 310.62□□□□□ -0.713e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 VRK1-206ENST00000557222 1029 ntTSL 59.15□□□□□ -0.943e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 VRK1-207ENST00000557352 599 ntTSL 58.97□□□□□ -0.973e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 RPS24-202ENST00000372360 510 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.013e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 RPS24-210ENST00000478655 727 ntTSL 1 (best)7.89□□□□□ -1.153e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.193e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 RPS24-213ENST00000485708 544 ntTSL 26.83□□□□□ -1.323e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 FXR1-204ENST00000461044 601 ntTSL 45.26□□□□□ -1.573e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 FUBP1-205ENST00000470287 726 ntTSL 33.21□□□□□ -1.93e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 DDX39B-217ENST00000474961 974 ntTSL 210.24□□□□□ -0.771e-6■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 VEGFA-214ENST00000493786 551 ntTSL 28.15□□□□□ -1.14e-7■■□□□ 14.4
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.444e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.344e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.694e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-218ENST00000454523 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.85■□□□□ 0.454e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-207ENST00000361140 2701 ntTSL 1 (best)17.76■□□□□ 0.434e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.364e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.334e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-217ENST00000443231 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.04■□□□□ 0.324e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-221ENST00000476093 1037 ntTSL 315.89■□□□□ 0.134e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-220ENST00000476027 927 ntTSL 314.77□□□□□ -0.054e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.084e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.134e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-209ENST00000368330 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.444e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-204ENST00000354691 2498 ntTSL 211.8□□□□□ -0.524e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-215ENST00000436865 2684 ntTSL 1 (best)9.28□□□□□ -0.924e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 YY1AP1-203ENST00000347088 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.954e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 BAG6-250ENST00000451898 993 ntTSL 319.98■□□□□ 0.792e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 BAG6-248ENST00000441054 654 ntTSL 318.89■□□□□ 0.612e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 BAG6-240ENST00000424480 1056 ntTSL 217.65■□□□□ 0.422e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 AC092073.1-201ENST00000592740 625 ntAPPRIS P1 TSL 318.51■□□□□ 0.553e-8■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 GPI-203ENST00000586077 3053 nt11.79□□□□□ -0.523e-8■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 MPP1-210ENST00000462825 587 ntTSL 414.26□□□□□ -0.131e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 MPP1-214ENST00000488694 550 ntTSL 28.01□□□□□ -1.131e-6■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 DMTF1-230ENST00000580710 635 ntTSL 526.58■■□□□ 1.852e-7■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 DMTF1-226ENST00000579592 579 ntTSL 416.83■□□□□ 0.282e-7■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 DMTF1-237ENST00000584457 569 ntTSL 416.29■□□□□ 0.22e-7■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 DMTF1-205ENST00000414630 627 ntTSL 59.02□□□□□ -0.972e-7■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 DMTF1-212ENST00000432366 557 ntTSL 58.93□□□□□ -0.982e-7■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 DMTF1-217ENST00000448598 572 ntTSL 47.26□□□□□ -1.252e-7■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 DMTF1-207ENST00000423590 545 ntTSL 56.15□□□□□ -1.422e-7■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 DMTF1-210ENST00000428819 533 ntTSL 45.76□□□□□ -1.492e-7■■□□□ 14.3
UTP3Q9NQZ2 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.187e-6■■□□□ 14.2
UTP3Q9NQZ2 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.057e-6■■□□□ 14.2
UTP3Q9NQZ2 ORC6-204ENST00000566860 1699 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.217e-6■■□□□ 14.2
UTP3Q9NQZ2 ORC6-209ENST00000575571 771 ntTSL 311.83□□□□□ -0.527e-6■■□□□ 14.2
UTP3Q9NQZ2 ORC6-205ENST00000567000 1560 ntTSL 210.97□□□□□ -0.657e-6■■□□□ 14.2
UTP3Q9NQZ2 SRSF1-202ENST00000578430 689 ntTSL 214.37□□□□□ -0.111e-6■■□□□ 14.2
UTP3Q9NQZ2 PPIB-203ENST00000561048 1208 ntTSL 1 (best)14.3□□□□□ -0.124e-9■■□□□ 14.1
UTP3Q9NQZ2 EIF2AK1-203ENST00000431744 806 ntTSL 327.8■■■□□ 2.042e-8■■□□□ 14.1
UTP3Q9NQZ2 EIF2AK1-204ENST00000446699 573 ntTSL 427.8■■■□□ 2.042e-8■■□□□ 14.1
UTP3Q9NQZ2 EIF2AK1-205ENST00000461493 631 ntTSL 221.67■■□□□ 1.062e-8■■□□□ 14.1
UTP3Q9NQZ2 EIF2AK1-206ENST00000463213 791 ntTSL 217.37■□□□□ 0.372e-8■■□□□ 14.1
UTP3Q9NQZ2 CDC27-218ENST00000575830 397 ntTSL 56.49□□□□□ -1.372e-8■■□□□ 14.1
UTP3Q9NQZ2 XPO1-219ENST00000481073 3706 ntTSL 23.77□□□□□ -1.812e-6■■□□□ 14.1
UTP3Q9NQZ2 VEGFA-221ENST00000520265 336 ntTSL 515.2■□□□□ 0.021e-6■■□□□ 14
UTP3Q9NQZ2 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.061e-6■■□□□ 14
UTP3Q9NQZ2 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.121e-6■■□□□ 14
UTP3Q9NQZ2 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.21e-6■■□□□ 14
UTP3Q9NQZ2 VEGFA-225ENST00000523950 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.271e-6■■□□□ 14
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