Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A4Q9Y6R1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms