Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHTOPQ9Y3Y2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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