Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NINLQ9Y2I6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms