Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms