Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX7Q9UNH6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX7Q9UNH6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms