Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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USP18Q9UMW8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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USP18Q9UMW8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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USP18Q9UMW8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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USP18Q9UMW8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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USP18Q9UMW8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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USP18Q9UMW8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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USP18Q9UMW8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP18Q9UMW8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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USP18Q9UMW8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP18Q9UMW8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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