Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLEC4EQ9ULY5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLEC4EQ9ULY5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLEC4EQ9ULY5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLEC4EQ9ULY5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLEC4EQ9ULY5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLEC4EQ9ULY5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLEC4EQ9ULY5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLEC4EQ9ULY5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLEC4EQ9ULY5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLEC4EQ9ULY5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLEC4EQ9ULY5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLEC4EQ9ULY5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLEC4EQ9ULY5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLEC4EQ9ULY5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLEC4EQ9ULY5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms