Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PADI3Q9ULW8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI3Q9ULW8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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