Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RCAN3Q9UKA8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms