Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms