Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms