Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DKK3Q9UBP4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms