Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG4Q9UBN1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms