Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR4Q9NYA4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms