Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPP4R2Q9NY27 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPP4R2Q9NY27 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms