Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK13-1Q9NX77 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ERVK13-1Q9NX77 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK13-1Q9NX77 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK13-1Q9NX77 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK13-1Q9NX77 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK13-1Q9NX77 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK13-1Q9NX77 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK13-1Q9NX77 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK13-1Q9NX77 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK13-1Q9NX77 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK13-1Q9NX77 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK13-1Q9NX77 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK13-1Q9NX77 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK13-1Q9NX77 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK13-1Q9NX77 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK13-1Q9NX77 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK13-1Q9NX77 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK13-1Q9NX77 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK13-1Q9NX77 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK13-1Q9NX77 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK13-1Q9NX77 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK13-1Q9NX77 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK13-1Q9NX77 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK13-1Q9NX77 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms