Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TBCCD1Q9NVR7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TBCCD1Q9NVR7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TBCCD1Q9NVR7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TBCCD1Q9NVR7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TBCCD1Q9NVR7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TBCCD1Q9NVR7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TBCCD1Q9NVR7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TBCCD1Q9NVR7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TBCCD1Q9NVR7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TBCCD1Q9NVR7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TBCCD1Q9NVR7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TBCCD1Q9NVR7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms