Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC38A7Q9NVC3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A7Q9NVC3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms