Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EMILIN3Q9NT22 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EMILIN3Q9NT22 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms