Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG3

UBN1, Ubinuclein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBN1Q9NPG3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBN1Q9NPG3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBN1Q9NPG3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms