Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FZD3Q9NPG1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FZD3Q9NPG1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FZD3Q9NPG1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FZD3Q9NPG1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FZD3Q9NPG1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FZD3Q9NPG1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
FZD3Q9NPG1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FZD3Q9NPG1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FZD3Q9NPG1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FZD3Q9NPG1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FZD3Q9NPG1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FZD3Q9NPG1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FZD3Q9NPG1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms