Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO1B3Q9NPD5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms