Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNPLA8Q9NP80 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNPLA8Q9NP80 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNPLA8Q9NP80 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNPLA8Q9NP80 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNPLA8Q9NP80 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNPLA8Q9NP80 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNPLA8Q9NP80 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNPLA8Q9NP80 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PNPLA8Q9NP80 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms