Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms